首先拳皇最早的故事背景是从公元197年开始的当时中国是三国时期如果你玩过三国群英传7的话你会发现游戏里面的日本也有一个君王叫卑弥呼是个类似巫婆的女人而拳皇的神乐千鹤据说是卑弥呼的嫡亲后裔（这个说法不能确定）而此时，有一个叫做大蛇的神却在日本兴风作浪，祸害百姓并且要求每半个月要百姓献上一个少女为自己享用当时日本有一个官员叫佐佐男被贬职到地方发现了大蛇的恶行后于是联合八尺琼和八咫这两家的人把一名叫做姬稻的女孩(草剃京的女朋友小雪就是这个姬稻的转世在97里小雪被七迦社抓起来替大蛇复活）当诱饵诱骗大蛇前来然后三人合力将大蛇的八个蛇头斩了下来这八个蛇头便化成八股力量变成了拳皇里的八杰集分别赋予八个人的身上。而大蛇死后在大蛇的腹中发现了一把剑剑身写有草剃最后君王卑弥呼因为这三人的功劳就把草剃剑还有国宝勾玉和一个神镜分别奖赏给佐佐男和八尺琼还有八咫佐佐男也改姓草剃八尺琼改姓八神八咫改姓神乐这三个家族被命名为三神器也就是
草剃剑(草剃)八尺琼勾玉(八神)八咫镜(神乐)
大蛇虽然肉身死了但是大蛇是个由人类邪恶一面所诞生的神只要人类还在大蛇的灵魂就一直在大蛇决定利用八杰集的力量使自己在死后的1800年后也就是公元197年的1800年后的1997年再度复活可是它害怕三神器到时候还会威胁到自己大蛇就利用八神一族对力量渴望的心理偷偷传授了八稚女这个禁招给八神一族于是八神拥有了大蛇之血的力量不过这个八稚女不是真的而真正的八稚女只有八杰集才会用所以拳皇96的boss高尼兹（高尼兹是八杰集之一）的必杀叫真·八稚女然后挑拨八神和草剃的关系所以这两族从此一直恶斗这就是八神庵常说的自己的命运
而拳皇这个游戏最初是一个大『乱』斗的游戏就是把一些snk公司曾经出品过的游戏人物都加到拳皇里面然后再设计一些新角『色』比如饿狼传说的特瑞安迪龙虎拳的坂崎良罗伯特还有超能力战士里的麻宫雅典娜拳崇等等
而拳皇94——97的故事主线就是大蛇一族
拳皇94是讲17岁的高中生草剃京和好友搏击高手红丸，奥运柔道冠军大门一同参加名为“拳皇”的武道会的故事参赛的除了草剃京队以外其他基本都是其他游戏的主人公可能这样才能显出草剃京的不俗实力最终京赢得了比赛在一艘船上见到了拳皇大赛主办人怒加怒加是一个独眼但实力很高的人而京到来时却发现自己的老爸草剃柴舟也在而且已经被怒加打伤原来怒加举办拳皇的目的是为了挑战世界的格斗家打败他们然后将他们铸成铜像。最后京打败了怒加怒加最后引爆了船由于京的父亲柴舟的帮助才把京他们救了出去而自己和怒加同归于尽到了95年草剃京又收到了拳皇大赛的邀请同时参赛的也有草剃家的死对头八神庵草剃京最终过关斩将赢得了拳皇95却发现大赛主办人还是94的的boss怒加怒加没有死却成了半机械人而且自己的老爸柴舟也被洗脑成为怒加的手下而怒加的实力明显比94强了很多（因为怒加此时拥有了大蛇之血的力量）但京最后还是打败了他怒加最后自爆去向不明（怒加在拳皇是一个不死之身的boss）而到了96年的拳皇比赛草剃京在比赛的最后见到了大赛主办人神乐千鹤神乐道出了事情的缘由因为自己的双胞姐姐神乐万龟前不久被八杰集的风之天王——高尼兹所杀所以她举办96拳皇是为了找两位高手（暗指草剃和八神）帮助自己打败高尼兹为姐姐报仇草剃欣然同意而八神最后经过了一番波折也同意了三人打败了高尼兹高尼兹被打败后说出了大蛇一族的由来又说出了94boss怒加曾为了获得大蛇之血而找到自己的但高尼兹最后挖了怒加一只眼睛最后高尼兹死后便化成一整风高死后八神体内的大蛇之血觉醒于是八神在比赛结束后暴走杀掉了自己的两位秘书麦卓和维斯（这两人同样是八杰集的成员）也杀掉了参赛的藤堂香橙（港漫说八神暗恋香橙纯属胡扯）
最后到了1997年大蛇即将在这一年复活而这次拳皇大赛的主办人是一个名为地狱乐队的三人七迦社夏尔米克里斯（三人也是八杰集成员因为实力强大和96boss高尼兹并称四大天王）草剃京等人经过一番苦战以后怒之队的成员丽安娜突然暴走而七迦社也道出了此次他们是为了大蛇复活而来而丽安娜的父亲也是八杰集的成员之一但是在丽安娜小的时候高尼兹找到丽的父亲要他效忠于大蛇她父亲不从高尼兹便把大蛇之血的力量赋予了他的女儿——丽安娜年幼的丽安娜暴走无意识杀了自己的双亲但后来却失去记忆被95怒之队的首领哈迪兰（哈迪兰就是那个独眼龙穿军装的眼睛是被95boss怒加挖去的克拉克和拉尔夫是他的部下）收为养女